>  тогда трудоёмкость разработки дистрибутивов со временем будет сокращаться

Да, будет. Однако пользоваться таким дистрибутивом станет невозможно. Просто потому что он будет занимать в разы больше места на носителе, и скорость упадёт в ноль. Даже на относительно мощном железе. Поэтому и говорю, что это путь в никуда. Кроме того все скромно умалчивают ещё об одной проблеме флетпака и подобных ему решений: они все завязаны на версии и варианты glibc. Потому что на них завязано ядро линукс. А без взаимодействия с ядром вы не запустите ничего. Полноценную автономность в этом случае может дать только виртуальная машина или контейнер, да и то - с оговорками. Но опять же таскать с каждым калькулятором свою копию ядра системы - а оно надо? Тем более, что решения, как уже сказал (точнее - намекнул), существуют. Только их никто не хочет замечать, потому что кому-то в таком случае придётся обходиться без золотых унитазов. И лежат они отнюдь не в плоскости IT, что очевидно.

Ну и не стоит, как уже сказал, использовать дистрибутивы для того, для чего они не предназначены. Существуют тот же Арч или Сизиф, где по большей части версии программ - свежайшие. Зачем ставить Дебиан или его производные, которые изначально рассчитаны на работу на серверах, и потом жаловаться на то, что у вас программы протухли? Естественно они протухнут. Потому что эти дистры рассчитаны на то, чтобы быть один раз установленными, а потом умереть вместе с железом. Без значительных обновлений. Потому что данная конкретная железяка до отбытия на свалку вряд ли претерпит серьёзные изменения, а значит и ядро ОС трогать особо не надо. Устаревание же ядра тянет за собой всё остальное.